Ғылым департаменті Ғылым және ғылыми кадрларды даярлау департаментінің бөлімшесі болып табылады, елдің стратегиялық басымдықтарына сәйкес ғылыми-зерттеу жұмыстарын үйлестіреді. Ғылым департаменті Президенттің Қазақстан халқына Жолдауын, «Қазақстан-2050» стратегиясын және Білім беру мен ғылымды дамытудың 2020-2025 жылдарға арналған мемлекеттік бағдарламасын іске асыруға бағытталған. Университеттің ғылыми күн тәртібі Ақмола облысының аумақтық даму бағдарламаларымен және өзінің аймақтық өзара іс-қимыл стратегиясымен тығыз интеграцияланған.

Университеттің ғылыми-зерттеу қызметі Президенттің Қазақстан халқына Жолдауын, «Қазақстан-2050» стратегиясын, Қазақстан Республикасының Білім беру мен ғылымды дамытудың 2020-2025 жылдарға арналған мемлекеттік бағдарламасын, Аймақтарды дамытудың 2020-2025 жылдарға арналған мемлекеттік бағдарламасын, Ақмола облысының аумақтық даму бағдарламасын және Уәлиханов атындағы КУ-дың 2021-2023 жылдарға арналған «Ғылыми жұмыс және аймақпен өзара әрекеттесу» бағытындағы даму бағдарламасын және басқа да стратегиялық және бағдарламалық құжаттарды іске асыруға бағытталған.

Ғылыми-зерттеу жұмыстары (бұдан әрі ҒЗТКЖ) Қазақстан Республикасының 2011 жылғы 18 ақпандағы «Ғылым туралы» Заңына, Қазақстан Республикасы Үкіметінің 2011 жылғы 16 мамырдағы № 519 қаулысымен бекітілген Ұлттық ғылыми кеңестер туралы ережеге, Қазақстан Республикасы Үкіметінің 2011 жылғы 25 мамырдағы № 575 қаулысымен бекітілген Ғылыми және (немесе) ғылыми-техникалық қызметті базалық, гранттық және бағдарламалық-нысаналы қаржыландыру ережелеріне және Қазақстан Республикасы Үкіметінің 2011 жылғы 1 тамыздағы № 891 қаулысымен бекітілген Мемлекеттік ғылыми-техникалық сараптама жүргізу ережелеріне сәйкес жүргізіледі.

Қызметтің негізгі бағыттары - ғылыми журналдарды басып шығару және ғалымдардың баспа қызметін қолдау. Университет үнемі ірі ғылыми конференциялар өткізеді және тиісті ғылыми жобалардың ашық дерекқорын жүргізеді. Зерттеу нәтижелерін коммерцияландыруға және зерттеу жұмыстары жүйесі мен Шоқан зерттеу бастамасы арқылы жас ғалымдардың дамуына ерекше назар аударылады.

Негізгі шешімдерді Ғылыми-техникалық кеңес және Диссертациялық кеңес үйлестіреді, ал Зерттеу этикасы жөніндегі комитет академиялық стандарттарға сәйкестікті қадағалайды. Университеттегі жас зерттеушілерді біріктіретін Жас ғалымдар мен студенттер кеңесі ғылыми қоғамдастықтың болашағын қалыптастыруда белсенді рөл атқарады. Кафедра адами ресурстардың өсуіне және аймақтың өркендеуіне ықпал ететін тиімді ғылыми экожүйе құруға ұмтылады.